巴音郭楞州是一个多湖泊地区，湖泊总面积2398km2(不包括干涸的罗布泊和台特巴湖)，超过1km2的湖泊 69个。巴州境内湖泊均属内陆湖，博湖为淡水湖，其余湖泊多属咸水湖。博湖是我国最大的内陆淡水湖，位于中天山南部，焉耆盆地最低洼处，为开都河、黄水沟等河流的归宿地，也是孔雀河的源头，对开都河、孔雀河的径流量具有良好的人工反调节及调节作用。博湖大湖东西长约55km，南北宽约25km，多年平均水面面积971km2，容积73.0×108m3，平均水深7.52m。
　　2009年，巴音郭楞州实现全口径财政收入66.91亿元，比上年下降29.0%，其中：地方财政收入33.69亿元，比上年增长6.9%，一般预算收入26.60亿元，比上年增长3.8%。在一般预算收入中，税收收入完成23.01亿元，比上年增长5.5%，占财政一般预算收入的86.5%。地方财政支出74.23亿元，比上年增长20.7%。其中：财政一般预算支出66.57亿元，比上年增长20.4%。金融信贷运行平稳。2009年末，金融机构各项存款余额425.95亿元，比上年增加76.44亿元，其中：企业单位存款93.17亿元，比上年增加16.56亿元，居民储蓄存款余额247.17亿元，比上年增加46.17亿元。2009年末，金融机构各项贷款余额198.15亿元，比上年增加61.6亿元。保险事业快速发展。全州共有各类保险公司15家，全年保费收入12.32亿元，比上年增长4.8%。其中：财产险保费收入5.68亿元，增长13.9%，占总保费的46.1%；人身险保费收入6.65亿元，下降1.8%，占总保费的53.9%；全年各类保险赔款支出4.07亿元，赔付率为33.0%，其中：财产险赔款支付2.63亿元，占总赔款64.6%，寿险赔款支付1.44亿元，占总赔款35.4%。
　　巴音郭楞州自然资源呈现多样性，动植物资源丰富。有野生动物73种，占全疆野生动物种数 的56％；巴州分布的名贵野生动物有野骆驼、大天鹅、普氏原羚、塔里木兔、马鹿、罗布泊盘羊、白尾地鸦、新疆大头鱼等：有野生植物2200多种，经济价值较高的野生植物有罗布麻、芦苇、甘草、紫草、羌活、麻黄、香蒲等20余种。矿产资源丰富， 巴州已发现74种矿产，矿产地681处。全国三大气田之一的塔里木天然气田。以石油、天然气、钾盐矿产、菱镁矿、蛭石、石棉、红柱石、饰面用花岗岩等为巴州优势矿产，其中蛭石、红柱石、钾盐、菱镁矿储量为全国之冠。